Evil Genius 2修补程序1.1.3已发布，它提供了一些漏洞修复程序，这些漏洞会使玩家在执行某些辅助任务时处于软锁定状态，并使欺骗活动更加可行。
此最新修补程序的重点是使游戏中的欺骗活动对玩家更加容易。 这主要是通过减少司法特工力量进行反击的机会来实现的。 现在，玩家可以在全球范围内降低热火队的水平，并确保出现的所有特工都能迅速分散注意力。
在更新之前，特工和士兵发现入侵玩家的岛屿并屠杀他们的代客部队太容易了。 随着热量水平在每个区域的升高，这种情况只会变得更加频繁，因此此修补程序应立即产生明显的影响。
该修补程序解决的另一个问题是在完成之前可能会中断的其他故事。 犯罪主宰在战斗之外丧命以及气体云在故事完成后仍无法散布的问题现在已得到解决。 这些修补程序应使玩家能够完成大多数令人讨厌的附带故事，否则这些故事将使他们无法再解决。
其他一般性修复措施包括显着降低平均情报特工进行反击的机会，提高警卫在警卫室的侦察能力，以及即使您在他们面前谋杀了一名特工，乘客仍然能够从游轮上离开。